Τον Σταύρο Θωμαδάκη, οικονομικό επιθεωρητή του υπουργείου Οικονομικών, τοποθέτησε με απόφασή του ο υπουργός Οικονομικών Ευκλείδης Τσακαλώτος, στην θέση του επικεφαλής του ΣΔΟΕ.
Ο Σταύρος Θωμαδάκης αναλαμβάνει τη θέση του μετακλητού ειδικού γραμματέα του Σώματος Δίωξης Οικονομικού Εγκλήματος, αντικαθιστώντας τον δικηγόρο Κωνσταντίνο Χρήστου που παραιτήθηκε από την θέση του, για να αναλάβει γραμματέας Διαφάνειας, μετά τον ανασχηματισμό του περασμένου Νοεμβρίου.
Ο Στ. Θωμαδάκης διατελούσε διευθυντής στην Υπηρεσία Ερευνών και Διασφάλισης Δημοσίων Εσόδων Αττικής (ΥΕΔΔΕ) της γενικής γραμματείας Δημοσίων Εσόδων (ΓΓΔΕ).
Είναι πτυχιούχος του τμήματος Οικονομικών Επιστημών του Πανεπιστημίου Αθηνών και υπηρετεί στο υπουργείο Οικονομικών από το 1984. Έχει υπηρετήσει σε διάφορες υπηρεσίες του υπουργείου, μεταξύ των οποίων η Κ.Υ. (Κ.Β.Σ. περίπου πέντε έτη) και η ΥΠ.Ε.Δ.Α.. Από τον Νοέμβριο 1996, συμμετείχε στην ομάδα δημιουργίας του ΣΔΟΕ, στο οποίο και υπηρέτησε από την έναρξη λειτουργίας του, τον Απρίλιο 1997 έως και τον Απρίλιο 2012, που μετατάχθηκε από τον κλάδο των εφοριακών στον κλάδο των Οικονομικών Επιθεωρητών. Στην Οικονομική Επιθεώρηση τοποθετήθηκε αρχικά στη Διεύθυνση Οικονομικής Επιθεώρησης Αθηνών και, τον Φεβρουάριο 2013, μετακινήθηκε στη Διεύθυνση Επιθεώρησης Υπηρεσιών. Από τον Μάιο 2014, ημερομηνία έναρξης λειτουργίας της Υπηρεσίας Ερευνών και Διασφάλισης Δημοσίων Εσόδων (Υ.Ε.Δ.Δ.Ε.), έως και τον Δεκέμβριο 2016, εκτελούσε χρέη αναπληρωτή προϊσταμένου Διεύθυνσης και, στη συνέχεια, τοποθετήθηκε προϊστάμενος Διεύθυνσης της υπηρεσίας. Έχει συμμετάσχει σε μεγάλο αριθμό συμβουλίων, επιτροπών και ομάδων εργασίας, σε θέματα καταπολέμησης φοροδιαφυγής και φοροαποφυγής