Το Πανεπιστήμιο Κρήτης προστέθηκε στα ΑΕΙ που δηλώνουν (έχουν προηγηθεί το ΕΚΠΑ και το ΑΠΘ) ότι δεν μπορούν να λειτουργήσουν το 2016 μετά και τη νέα μείωση της κρατικής του επιχορήγησης. «Το Πανεπιστήμιο Κρήτης καλείται να καταρτίσει και να υλοποιήσει για το 2016, ένα προϋπολογισμό με βάση τις επιχορηγήσεις του υπουργείου Παιδείας, που στο σκέλος των λειτουργικών δαπανών είναι μειωμένος σε ποσοστό 20 % σε σχέση με εκείνο του 2015.
Ηδη, ο προϋπολογισμός του 2015, που με τη σειρά του ήταν μειωμένος σε σχέση με το 2014 κατά 24,6 % έχει οδηγήσει πολλές απαραίτητες ακαδημαϊκές δραστηριότητες σε συρρίκνωση» αναφέρει ανακοίνωση της πρυτανείας του ιδρύματος, η οποία τονίζει: «Είναι λοιπόν αδύνατο να καταρτισθεί ρεαλιστικός προϋπολογισμός για το 2016 που στο σκέλος των λειτουργικών δαπανών είναι ακόμη περισσότερο μειωμένος, με τις ανελαστικές δαπάνες στις οποίες περιλαμβάνονται οι υποχρεώσεις στις επιχειρήσεις κοινής ωφέλειας, να υπερκαλύπτουν τη διαθέσιμη πίστωση από το υπουργείο Παιδείας».